脑外科是江西省副主委及南昌市主委挂靠单位，是南昌大学神经外科硕士点。是我院重点建设学科之一，是南昌市颅脑损伤、急重性脑血管疾病的主要救治基地及江西省神经介入创始科室。1995年在全省率先开展了脑动脉瘤、脑动静脉畸形及颈内动脉海绵窦瘘栓塞术。除颅脑损伤、脑血管病、脑积水、脑肿瘤外，还开展了功能神外亚专业，能够独立完成三叉神经痛、面肌痉挛微血管减压术。2018年建设完成NICU(神经外科重症监护室）亚专业，配置床位14张。科室配置了先进的手术显微镜及神经内镜。